目录

一、R语言

1. R官网

2. R介绍

二、直接安装R

1. 下载

2. 安装

三、Pycharm使用R

1. 安装Pycharm

2. R Language for IntelliJ插件

3. R设置

报错

4. R软件包

安装

加载

查看已安装的包

四、使用Anaconda创建R语言虚拟环境

1. 安装Anaconda

2. 创建R语言虚拟环境

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一、R语言

1. R官网

R: The R Project for Statistical Computing (r-project.org)https://www.r-project.org/

2. R介绍

        R语言是一种用于统计计算和数据分析的编程语言。它具有丰富的数据处理、统计建模和数据可视化功能，广泛应用于数据科学、统计学、机器学习等领域。

        R语言拥有强大的数据处理和操控能力，可以处理各种类型和规模的数据。它提供了丰富的统计方法和模型，包括线性回归、逻辑回归、决策树、聚类分析等常见的机器学习和统计方法。此外，R语言还有丰富的可视化功能，可以创建各种类型的图表和可视化展示。

        R语言具有开源社区的支持，有大量的开源包和库可供使用，可以扩展R的功能和应用领域。在R语言社区中，你可以找到各种各样的包，用于数据处理、统计建模、机器学习、自然语言处理等领域。

        R语言具有易于学习和使用的语法，对于统计学和数据分析的初学者来说是很友好的。同时，R还具有可扩展性和可重复性，可以进行自动化分析流程和报告生成。

二、直接安装R

1. 下载

The Comprehensive R Archive Network (tsinghua.edu.cn)https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/

2. 安装

• 选择安装位置

• 自定义组件

•  禁止自启动

• 菜单文件夹名称

三、Pycharm使用R

1. 安装Pycharm

参照前文：

PyCharm专业版安装教程（使用jetbrains toolbox管理；学生认证、学信网验证码申请）_pycharm 验证码_QomolangmaH的博客-CSDN博客https://blog.csdn.net/m0_63834988/article/details/128692959?spm=1001.2014.3001.5502

2. R Language for IntelliJ插件

• 文件——设置

• 插件

3. R设置

 （自动检测）

 

报错

 Warning in (function (file = "", n = NULL, text = NULL, prompt = "?", keep.source = getOption("keep.source"),  :
  argument encoding="UTF-8" is ignored in MBCS locales

看着碍眼就碍眼吧，不影响，可以修改：

Sys.setlocale(category = 'LC_ALL', locale = 'English_United States.1252')

如果修改，不使用R后记得改回来，否则系统会有其它报错（如：通知乱码）

Sys.setlocale("LC_ALL","Chinese")

4. R软件包

安装

install.packages("hdf5r")

加载

library(hdf5r)

        加载hdf5r包后，才可以使用它提供的函数和方法。

查看已安装的包

installed_packages <- installed.packages()
package_names <- rownames(installed_packages)

打印已安装的包名称

print(package_names)

四、使用Anaconda创建R语言虚拟环境

1. 安装Anaconda

参照前文：

win11 安装 Anaconda（2022.10）+pycharm（2022.3/2023.1.4）+配置虚拟环境_QomolangmaH的博客-CSDN博客https://blog.csdn.net/m0_63834988/article/details/128693741?spm=1001.2014.3001.5502

2. 创建R语言虚拟环境

conda create -n R4.1.3 r-base==4.1.3

conda activate R4.1.3

conda install r-seurat

library(Seurat)